1、防止堵塞最经济实用的方法就是滴灌水的预处理，预处理做的越好，发生堵塞的征象就越少。要根据水质及流量，在水泵取水口处用铁蒺藜作3道拦污栅，安装的拦污栅树木不等，从小到大，可以拦走悬浮泥沙和杂物。或者把河水引到蓄水池中，经过沉淀泥沙后备用，并且加盖避光，防有杂物进入。

2、精确使用滴灌施肥，要选择可溶性的肥料，施肥器也必须安装。但是设备正常才可以使用，施肥结束之后要用清水对体系进行5分钟的清理，防止管道中剩余的肥料沉淀。

3、要定期冲洗滴灌管、清洗过滤器。滴灌管第一次使用时要对末端的堵头清洗，把杂质洗掉，使用5次后再次冲洗。灌水前要定期检查过滤器，冲洗去污。假如滤网有损坏，要及时清理。